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伯樂(Bio-Rad)的CFX Opus系列實時熒光定量PCR儀配合Deep Well(深孔)模塊(通常指96孔深孔板模塊)時,其性能驗證是一個系統性的過程,旨在確保儀器在關鍵性能指標上達到制造商規格和實驗室質量標準。性能驗證通常包括以下幾個核心內容:
一、伯樂CFX OpusDeepwell實時熒光定量PCR儀光學檢測系統驗證
1、熒光靈敏度與線性范圍:使用已知濃度的熒光染料(如ROX、FAM等)進行系列稀釋,驗證儀器在不同通道下檢測低濃度熒光信號的能力,以及信號強度與濃度之間的線性關系(R2 > 0.99)。
2、交叉串擾測試:檢測各熒光通道之間的信號隔離度,確保一個通道的強信號不會“泄漏"到相鄰通道。
3、背景噪聲評估:在無模板條件下運行,測量各通道的本底熒光值,確保其在允許的低噪聲范圍內。
二、伯樂CFX OpusDeepwell實時熒光定量PCR儀熱循環系統驗證
1、溫度準確性:使用經過校準的外部溫度探頭(如NIST可追溯探頭)插入深孔板的不同位置(特別是邊緣和中心),測量孔內實際溫度與設定溫度的偏差(通常要求±0.5°C以內)。
2、溫度均一性:驗證深孔板不同孔位在升/降溫過程中溫度的均勻性,這對實驗結果的可重復性至關重要。
3、升/降溫速率:驗證儀器能否達到宣稱的升降溫速度(如MAX5°C/秒),這對某些快速PCR程序很重要。
三、動力學與重復性驗證
1、標準曲線與擴增效率:使用已知拷貝數的標準品(如質粒DNA、體外轉錄RNA或基因組DNA),在深孔模塊中進行梯度稀釋(至少5個點,建議3次重復),運行qPCR反應。
擴增效率:應在90%-110%之間,理想值為100%。
線性相關系數(R2):應 > 0.990。
動態范圍:驗證儀器能準確定量跨越多個數量級(如10^1 到 10^6 拷貝)的模板。
2、重復性(精密度):
板內重復性:同一塊板上同一樣本多個復孔的Ct值變異系數(CV)。
板間重復性:不同時間、不同操作者在不同板上運行同一批次樣本的Ct值CV。
通常要求CV < 2%(針對Ct值)。
四、與淺孔模塊的性能對比
由于深孔模塊的反應體積更大(通常可達50 μL或更多,而標準模塊為20-25 μL),可能需要驗證:
1、在更大反應體積下,熱傳導是否均勻、穩定。
2、光學系統能否對更深液柱進行準確檢測。
3、擴增效率與靈敏度是否與標準模塊一致。
五、如何進行驗證?
1、遵循制造商指南:伯樂通常會提供詳細的性能驗證方案和推薦使用的驗證試劑盒(例如,使用Bio-Rad Precision Melt或qPCR驗證板)。
2、使用標準物質:建議使用標準品(如來自ATCC或NIST的核酸標準)。
3、制定SOP并記錄:將驗證過程標準化,并詳細記錄所有結果(溫度數據、標準曲線圖、CV值等),形成性能驗證報告。
4、定期執行:性能驗證應在以下情況執行:
新儀器安裝后
更換或維修關鍵部件后(如光學模塊、熱循環模塊)
定期(如每年) 或根據實驗室質量管理要求(如ISO 15189)進行
更換實驗模塊后(如從標準96孔模塊換為深孔模塊)。
總結要點
對于CFX Opus Deep Well模塊的性能驗證,核心是確認其在更大反應體積下,依然能保證優異的熱循環均勻性、準確的溫度控制、高靈敏度和穩定的光學檢測能力。驗證應側重于實際qPCR實驗的模擬,通過運行標準曲線和重復性實驗來獲得最關鍵的性能數據。